生物活性肽与消化系统
消化系统由消化管和消化腺两部分组成。消化管包括我们熟知的咽、食管、胃、小肠、大肠。消化腺包括唾液腺、肝和胰腺。在消化管和消化腺的表面和内部都有胶原蛋白的存在。在消化系统中常见的疾病有胃炎、胃溃疡、便秘、酒精肝、脂肪肝等。
生物活性肽作用于消化系统可以：
修复炎症部位，保护胃黏膜，抵抗炎症对胃的损害；
调节肠道菌群，有效抑菌、抗炎，修复肠道中的炎症病变，预防便秘和肠癌；
对酒精引起的肝损伤有保护作用，促进酒精代谢，减轻酒精对肝脏的损伤；
此外，生物活性肽还可以促进脂肪的转运和利用，预防脂肪肝的形成。
生物活性肽与骨骼系统
骨骼系统包括：骨、骨连结和骨骼肌。在骨骼当中充足的胶原蛋白会链接形成一张网，钙等无机盐附着在胶原纤维上，形成骨骼。在腿部，骨骼链接的膝关节，有关节软骨的存在，在脊椎骨链接的地方有椎间盘的存在。
它们的组成都有胶原蛋白的参与，胶原蛋白的流失和减少都可能造成骨骼方面的疾病。骨骼系统中常见的疾病有骨质疏松、腰椎病、颈椎病、关节炎、股骨头坏死、骨折等等，大都与钙、胶原蛋白的流失有关。
生物活性肽作用于骨骼系统可以促进钙等无机盐的吸收；给胶原蛋白的合成提供原料，为矿物质的沉积提供框架；激活成骨细胞和破骨细胞的活性，促进骨骼恢复健康，缓解炎症。
生物活性肽与免疫系统
免疫系统是人体抵御病原菌侵犯最重要的保卫系统。这个系统由免疫器官、免疫细胞，以及免疫分子所组成。我们的免疫系统主要是抵抗外来的病原菌的侵害，如果免疫系统去攻击自身正常的器官和组织则会得自身免疫系统疾病，例如红斑狼疮、类风湿性关节炎。如果免疫力低下容易得感冒，受到细菌和病毒的感染。
生物活性肽中有一类抗菌肽，它对细菌、病毒等都有杀灭作用，能起到广谱抗菌作用，从而协助自身免疫系统工作，提高免疫力：生物活性肽还可以激活免疫细胞，促进免疫细胞的增殖，从而提高免疫力；生物活性肽还可以修复系统红斑狼疮造成的皮肤损伤和缓解关节疼痛等症状。
呼吸系统包括呼吸道和肺。主要工作是呼出二氧化碳，吸进新鲜氧气。呼吸系统常见的疾病有支气管炎，肺间质纤维化，哮喘、肺癌等。其病因多涉及炎症，细菌、病毒感染。
生物活性肽有很好的抑菌抗炎作用，可以提高白细胞的吞噬能力，提升免疫力，缓解炎症；生物活性肽还可以促进肺中老痰和累积杂质的排出，清理肺部，对呼吸系统的健康有很好作用。
生物活性肽与循环系统
循环系统：指血液循环系统，人体的循环包括体循环和肺循环。血液循环系统由血液、血管和心脏组成。血液循环系统是血液在体内流动的通道，分为心血管系统和淋巴系统两部分。
淋巴系统是静脉系统的辅助装置。循环系统不好容易手脚冰凉，跟血液有关的疾病大都是循环系统的疾病，主要有脉管炎，静脉曲张，冠心病，高血压，脑卒中等。
在生物活性肽中有一类降压肽可抑制血管紧张素转换酶活性，起到降低血压的作用；生物活性肽中的胶原肽还可以为血管提供原料，让血管恢复弹性和柔韧性，促进循环，改善手脚冰凉：生物活性肽有抗氧化，降血脂的作用，尤其是对坏胆固醇的降低更明显对于高脂血症形成的一系列潜在的健康风险都有预防作用。
内分泌系统是机体的重要调节系统，它与神经系统相辅相成，共同调节机体的生长发育和各种代谢，维持内环境的稳定，并影响行为和控制生殖等。常见的内分泌疾病有肥胖、糖尿病、痛风、甲亢等疾病。
生物活性肽对于内分泌系统的调节是多样的。例如生物活性肽有促进新陈代谢的作用，有利于促进脂肪的代谢：痛风是嘌呤代谢异常所引起的，在生活中我们除了控制饮食外，生物活性肽还可以帮助我们溶解尿酸结晶t缓解尿酸盐结晶所致的关节肿、红、胀的情况。
生物活性肽与神经系统
神经系统控制着肌肉的活动，协调各个组织和器官，建立和接受外来情报，并进行协调，所以神经系统是动物体最重要的连络和控制系统。与神经系统有关的疾病有失眠、老年痴呆、面瘫、神经性头疼等。
在生活活性肽中有类阿片活性肽，它具有镇痛作用，而且不像其他镇痛药一样有副作用，没有依赖性生物活性肽调节睡眠的效果也很显著，对于失眠有很好的调节作用；生物活性肽还有的抵抗自由基、抗氧化效果，对大脑的神经细胞有很好的保护作用，对于老年痴呆、帕金森综合症有很好的缓解作用。
生物活性肽与生殖和泌尿系统
泌尿系统包括：肾脏、输尿管、膀胱、尿道。女性生殖系统包括：卵巢、输卵管、子宫、阴道和外生殖器等。男性生殖系统包括：睾丸、附睾、前列腺、尿道等。常见的生殖泌尿疾病有：肾炎、前列腺炎、尿道感染、内分泌失调、乳腺疾病等。
生物活性肽具有较强的内分泌调节作用，对内分泌失调引起的疾病如月经不调，乳腺增生等都有很好的调节作用；
在一些海洋活性肽含有丰富的精氨酸，对促进男性精子的生成，提高精子运动能量有重要的作用；
男性的前列腺主要为结缔组织，结缔组织的主要原料是胶原蛋白，所以补充生物活性肽对前列腺组织十分有益。
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