随着对多肽种类和功能的深入研究，近年来对多肽类药物的开发已经发展到疾病防治的各个领域。世界上肽类药物的研究领域目前集中在抗菌活性肽、抗病毒肽、抗肿瘤肽、用于心脑血管疾病的多肽、多肽疫苗、以及其他抑制炎症发生、促进伤口血管再生、加速皮肤深度伤口的愈合等药用肽类。
1）抗肿瘤多肽
肿瘤的发生是多种因素的结果，但最终都要涉及癌基因的表达调控。现在已经发现了很多与肿瘤相关的基因以及调控因子，筛选与这些基因及调控因子特异结合的多肽，已经成为寻找抗癌药物的新热点。美国学者就发现了一个能够在体内显著抑制癌细胞的六肽，瑞典科学家也发现了一个能够诱导肿瘤细胞凋亡的八肽。
2）抗病毒多肽
病毒通过与宿主细胞上的特异受体结合吸附细胞，依赖其自身的特异蛋白酶进行蛋白质的加工机核酸复制。因此人们可以从肽库中筛选与宿主细胞受体结合的多肽，或者与病毒蛋白酶等活性位点结合的多肽，用于抗病毒的治疗。
3）多肽疫苗
目前世界上对病毒多肽疫苗进行了大量的研究与开发，多肽疫苗与核酸疫苗是目前疫苗研究领域内较为重视的研究方面之一。美国正在进行开发疟疾多价抗原多肽疫苗，而我国在多种多肽疫苗研究方面也做了大量的工作。
4）抗菌活性肽
根据结构抗菌活性肽可分为环状肽、糖肽和脂肽。由于抗生素过度使用会导致人类致病菌对其产生抗药性，所以使用抗菌肽代替抗生素是将来生物医学发展的必然。
5）用于心脑血管疾病的多肽
很多植物中含有能降血压、调血脂、溶血栓等作用的物质，这些物质不仅可以做药物，也可作为保健食品。现已发现其中很多有效成分是小分子肽，因此从植物中发现新的活性肽并进行研究和开发已经成为多肽类药物研究的热点。
肽类物质的研究应用方面还有很多，其还有调节认知多肽、诊断用多肽及机体细胞修复多肽等多方面。顺应时代的发展，国内市场已经出现大量以天然食物为来源的食源性肽类物质，其虽不像肽类药物那样具有疾病治疗作用，但是大量研究文献都表明，食源性肽类物质具有包括降压、降脂、抗氧化、抗菌、抑制肿瘤细胞活性等在内的多种生物学作用，食源性肽类物质已经广泛应用于功能食品、健康食品、专用食品、功能饮料、营养强化食品及特医食品等领域的产品开发，且市场反应良好。
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