概括而言，新的肽类药物资源可以从以下几个方面考虑。
动物来源的肽类物质：
在动物的脏器、组织内含有难以计数的不同类别的活性肽类物质，每种物质都具有特定的生理功能或活性。因此，目前已用于提制某种肽类药物的原料，仍有进一步研究开发的价值。如提制胸腺素或胸腺肽的胸腺组织，还可从中提取淋巴细胞抑素等物质。对一些以前开发较少的脏器也可以进行新的开发，以发现新的肽类来源。另外，还可利用不同生物同一类型组织获得同种生物活性肽，或者可以扩大原料来源。
植物来源的肽类物质：
由植物来源的活性肽目前已引起人们的关注。我国已经从植物中通过酶解、分离、纯化获得了很多活性肽并开发为新药和保健品。如从某些蔬菜、豆类、薯类、谷物等中制备了多种有发展潜力的活性肽。从传统中药材中制备活性肽也将是肽类药物研究开发的方向。
昆虫来源的肽类物质：
昆虫是世界上较大的生物种群，除海洋之外，几乎所有的生态环境都有昆虫存在。研究发现，当昆虫受到外来病菌的侵袭时，体内会产生大量的抗菌肽，这些抗菌肽可以迅速杀灭病菌。到目前为止，在昆虫中已发现大量的抗细菌肽、抗真菌肽以及既抗细菌又抗真菌的抗菌肽。这些抗菌肽对病毒、原虫及癌细胞也有作用吗，并且对高等动物的正常细胞无毒害作用。
海洋来源的肽类物质：
海洋是一个蕴藏着许多生物活性物质的宝库。地球上的生物资源有约80%存在于海洋，其中约有50万种动物，13000余种植物，因此开发海洋肽类药物大有可为。
微生物来源的肽类物质：
微生物种类难以计数，不同种类的微生物代谢各异，因此微生物是产生生物活性物质的源泉，如在临床上广泛使用的免疫抑制剂环孢素就是微生物产生的多肽。
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